Con más de 150.000 lotes y un millón de especímenes, la Colección de Moluscos del MZUSP es la mayor de América Latina.
La representación de la colección es mundial, aunque con mayor énfasis en la región Neotropical y costa del Atlántico Oeste. También posee más de 1.200 especímenes tipos. Tal representatividad continúa creciendo, con colectas y proyectos de investigación, así como compra de colecciones e intercambios, lo que ha tornado la Colección de Moluscos cada vez más importante en el contexto de la Malacología mundial. Cerca de 2/3 de la colección está en vía húmeda. Los lotes son acondicionados en frascos especiales, en armarios deslizantes compactadores.