As missões do Museu de Zoologia são:
Contribuir com o avanço científico e o estabelecimento de políticas públicas em Biodiversidade através da pesquisa científica de qualidade integrada ao ensino e referenciada por padrões internacionais.
Formar docentes pesquisadores de excelência através dos seus programas de pós-graduação e pós-doutoramento e contribuir com o ensino de graduação de forma indissociável de suas atividades de pesquisa.
Oferecer produtos culturais e educação não formal (extensão) aos diversos segmentos da sociedade através de suas exposições públicas de longa duração, temporárias e itinerantes.
Estas missões consubstanciam-se nos seus acervos, em torno dos quais se organizam as atividades de pesquisa, ensino, extensão e de fiel depositário dos testemunhos materiais da biodiversidade.
